Der Münchner Flughafen wurde vom Bayerischen Umweltministerium als eines der ersten Unternehmen als „Blühender Betrieb“ ausgezeichnet. Im Rahmen des „Blühpakts Bayern“ würdigt das Ministerium so Betriebe, die sich in beispielhafter Weise für den Insektenschutz stark machen. Auf seinen mehr als 900 Hektar Grünflächen hat der Airport zahlreiche entsprechende Maßnahmen ergriffen: Durch die extensive Pflege der Flughafenwiesen leben auf dem Gelände eine Vielzahl von Tier- und Pflanzenarten. Blütenpflanzen können sich optimal entwickeln, da die Flächen nur zweimal im Jahr gemäht und keine Pflanzenschutzmittel eingesetzt werden. Zudem betreibt die FMG auf dem Flughafen-Campus mittlerweile vier „Insektenhotels“, in denen die Tiere überwintern und nisten können. Bereits 2016 startete die FMG überdies ein Projekt zum Schutz bedrohter Schmetterlingsarten im Freisinger Moos
